На сегодняшний день большой интерес для современной науки представляет концепция биологического разнообразия, являющаяся уникальной особенностью живой природы, обеспечивающая стабильность и устойчивость экосистемы, неотъемлемой частью которой является человек. Изменения внешней среды обусловлены не только увеличением или уменьшением абсолютного числа представителей флоры и фауны планеты, но и всех микроорганизмов, расположенных на ее поверхности [1]. Взаимосвязь симбиотических микроорганизмов природной среды (экобиома) с микробиотопами и микробиомом человека в целом определяет его иммунологическую толерантность. Микробиота кишечника эволюционно сложившаяся, сбалансированная микроэкосистема комменсальных симбиотических и условно-патогенных микроорганизмов (УПМ), поддерживающая и модулирующая тонкое равновесие иммунных реакций макроорганизма в предлагаемых условиях внешней среды [2,3]. Бактерии, расположившись в предложенных организмом экологических нишах (кожа, желудочно-кишечный, респираторный тракт, мочевыделительная система, плацента и др.), образуют сложные межвидовые сообщества с присущим для них метаболизмом, определяя колонизационную активность в оптимальных для себя средовых условиях. Настойчиво усиливающиеся негативные процессы воздействия на окружающую среду ведут к срыву адаптационных механизмов и, как следствие, развитию патологических состояний и болезней, в том числе аллергических [4,5].
Аллергия является серьезной проблемой мирового здравоохранения. По прогнозам Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ) XXI век станет веком аллергии. В последние годы отмечается устойчивая тенденция к увеличению частоты аллергических заболеваний (АЗ) у детей и появлению тяжелых, атипичных, резистентных к традиционным видам лечения форм. Сегодня уже не удивляет ситуация наличия у каждого человека в мире эпизода какой-либо аллергической реакции, проявления которой разнообразны и многогранны и могут носить эпизодический или хронический характер. По утверждению Всемирной организации по аллергии (World Allergy Organization, WAO) различные проявления АЗ имеет каждый второй пациент [6]. Ежегодное ухудшение характеристик окружающей среды, снижение качества продуктов питания и как следствие расширение спектра потенциально опасных аллергенов обуславливает наличие у 90% детей первого года жизни кожных проявлений аллергии, как правило, с ранним дебютом и тяжелым течением. Европейская Академия Аллергологии и Клинической Иммунологии (European Academy of Allergy and Clinical Immunology, EAACI) в июле 2017 г. обнародовала данные в отношении «аллергического кризиса в Европе» и необходимости принятия срочных мер по его преодолению. В России от 17,5% до 35% населения страдают тем или иным АЗ, большую долю среди них занимает бронхиальная астма, объективно же показатель заболеваемости на порядок выше [7].
Известно, что АЗ, начинаясь в раннем детском возрасте с гастроинтестинальных проявлений пищевой аллергии, имеют стадийность в виде фаз атопического марша, приводя последовательно к атопическому дерматиту (АтД), аллергическому риниту и бронхиальной астме. Главным механизмом формирования аллергии признаны нарушения феномена оральной толерантности. Становление пищевой толерантности и снижение риска развития Th2-иммунного ответа зависят от формирования динамического равновесия симбиотной флоры кишечника [8].
В настоящее время имеется достаточное количество результатов исследований, в том числе и многоцентровых, свидетельствующих о роли кишечной микробиоты в формировании атопического фенотипа человека. Выявлены нарушения видового разнообразия микробиоты у новорожденных из группы риска по атопии. Медленное становление бифидофлоры кишечника приводит к замещению ее на смешанные полимикробные биопленки, представленные полирезистентными штаммами УПМ, что обуславливает нарушение процесса формирования иммунологической толерантности и вызывает аутосенсибилизацию с развитием аллергических реакций по IgE зависимому типу [9,10]. По некотором данным, основной причиной этих процессов является нарушение механизмов конкурентного взаимодействия лакто- и бифидофлоры младенца с агрессивными штаммами госпитального происхождения. Анализ бактериальных высевов детей первого года жизни, страдающих дисбиозом, выявил наличие представителей семейств Micrococcaceae Staphylococcus aureus и Enterobacteriaceae Klebsiella pneumonieae, Klebsiella oxytoca, а оценка антибиотикочувствительности культур подтвердила их госпитальное происхождение [11].
До настоящего времени главным направлением коррекции дисбиотических нарушений для формирования колонизационной резистентности микрофлоры кишечника являлось применение пробиотических препаратов [12,13]. Однако в последние годы увеличивается информация об отсутствии убедительной доказательной базы применения пробиотиков для лечения и профилактики атопии [14]. Вместе с тем активно проводятся исследования эффективности коррекции нарушений микробиоты с помощью селективной деконтаминации УПМ бактериофагами, которые являются альтернативой лечению антибиотиками и пробиотическими препаратами [15].
История бактериофагов началась с изучения антибактериального эффекта воды реки Ганг, описанного в 1896 г. английским бактериологом Э.Ханкиным во время эпидемии холеры в Индии. Учёный предположил, что вода при прохождении через бактериальный фильтр приобретала «целебные свойства». Впоследствии этот феномен был назван «парадоксом Ханкина». В 1898 г. русский микробиолог Н.Ф. Гамалея в своих трудах, посвященных исследованию сибирской язвы, установил и описал способность раствора дистиллированной воды разрушать культуры возбудителя Bacillus anthracis неизвестным агентом. Только в 1917 г. английский микробиолог Ф.Туорта совместно с канадско-французским ученым Ф. д`Эррель независимо друг от друга описали агенты, вызывающие разрушение бактерий, которые Ф.д`Эррелль назвал бактериофагами («пожирателями бактерий»).
Большой опыт в исследованиях и практическом применении бактериофагов имела Советская Россия. В 1917 г. российский микробиолог, основоположник фаготерапии Г.Г. Элиава случайно обнаружил бактерицидное действие реки Кура в одно время с опубликованием Ф.д`Эррелем итогов своего открытия. В результате плодотворного сотрудничества исследователей в 1923 г. была организована первая в СССР лаборатория, которая впоследствии была преобразована в Тбилисский институт микробиологии, эпидемиологии и бактериофагов. В последующие десятилетия производство фагов и фаговых «коктейлей» успешно развивалось. Огромное количество производственных форм применялись в условиях лечебных стационаров, имелся свободный доступ в аптечной сети, ежегодно увеличивалось количество промышленных предприятий, производящих фаговые лекарственные формы не только в Советском Союзе, но и в странах социалистического лагеря – Польше, Чехословакии. Активное производство бактериофагов для терапевтических целей началось в 1940-х гг. в НПО «Микроген». В настоящее время предприятие является крупнейшим отечественным производителем иммунобиологических препаратов, вакцин, анатоксинов, сывороток, препаратов крови, в том числе и бактериофагов. С 2009 г. на фармацевтическом рынке присутствует производитель бактериофагов «ООО НПЦ Микромир». Пополнение фаговой части коллекции происходит с использованием собственной уникальной методики выделения бактериофагов из природной среды. Одним из последних достижений компании является создание линейки фаговых препаратов на гелевой основе (Отофаг, Фагодент, Фагодерм, Фагогин). За рубежом также активно проводятся исследования эффективности бактериофагов. К примеру, с июля 2015 г. по январь 2017 г. проводилось международное проспективное мультицентровое рандомизированное простое слепое контролируемое клиническое исследование PhagoBurn, в котором оценивалась эффективность фаготерапии ожоговых ран, инфицированных Escherichia coli и Pseudomonas aeruginosa ( фаза I-II клинических испытаний). В ноябре 2015 г. американская компания AmpliPhi Bioscience Corporation начала исследование I фазы, посвященное трем препаратам: Ampliphage-001 – бактериофагу, предназначенному для лечения пациентов с легочной инфекцией, вызванной синегнойной палочкой на фоне муковисцидоза; Ampliphage-002 – бактериофагу для лечения пациентов с осложнёнными инфекциями кожи и мягких тканей, вызванных Staphylococcus aureus; Ampliophage-004 – бактериофагу против Clostridium difficile. Первые два препарата прошли доклинический этап исследования и входят сейчас в I фазу клинических испытаний. Данные базы PubMed свидетельствуют о ежегодном увеличении количества медицинских изданий, освещающих темы лечебного и профилактического применения бактериофагов. На сегодняшний день, бактериофаги остаются одним из самых эффективных средств реагирования на бактериальную угрозу [16, 17,18].
Бактериофаги — это уникальное явление природы, с одной стороны, за счет простоты своего строения, с другой – в связи с колоссальным разнообразием морфологии и потенциала действия [19, 20]. Результаты исследования зарубежных ученых показали, что бактериофаги являются важным компонентом микробиома. В ходе проведенного анализа высокопроизводительного секвенирования получены заключения о совместном сосуществовании с экосистемой кишечника, существенном влиянии бактериофагов на УПМ и моделирование микробиома [21]. Возрождение интереса к бактериофагам в последние годы связанно с появлением новых антибиотикорезистентных (АБР) форм микроорганизмов. Список АБР бактерий возглавляют Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Staphylococcus aureus, Streptococcus pneumoniae, Salmonella spp. В 2016 г. в США была выявлена пациентка со случаем заражения новым подвидом кишечной палочки, устойчивой к колистину – антибиотику «последнего резерва», не применяемому ни в одной отрасли производства. По расчетам британского исследования Review on Antimicrobial Resistance к 2050 г. от АБР будет умирать больше людей, чем от рака и диабета вместе взятых [22, 23].
Бактериофаг представляет собой высокотехнологичный биологический нанообъект биосферы (100 нм), содержащий уникальную генетическую программу, способный проникнуть внутрь бактериальной клетки и размножиться, вызывая ее разрушение. Фаговая частица состоит из головки (нуклеокапсида), который может иметь икосаэдрическую, сферическую, лимоноподобную и плеоморфную форму диаметром 45140 нм, а также отростка (хвоста) диаметром 1040 нм и длиной 100-200 нм (рис 1) .